税務的な観点からいうと、最初の2期は消費税が免除されますので、できるだけ第1期を長くとるということから、たとえば10月に設立するのであれば、毎年9月1日から10月31日(10月決算)とすることをおすすめします。
また、資金を有効に経費として使うという観点でいえば、最も売上の高い月を期初に設定するということでもよいでしょう。
たとえば、毎年7月が売上高のピークだとすれば、毎年7月1日から6月30日(6月決算)とするといった感じです。